📄 Category

systems biology

163 papers

Systeembiologie kijkt niet naar losse onderdelen van het leven, maar naar hoe al die delen samenwerken als één groot, dynamisch geheel. In plaats van alleen genen of eiwitten te bestuderen, proberen onderzoekers in dit veld de complexe netwerken te begrijpen die cellen en organismen in stand houden. Het is de kunst om het grote plaatje te zien, waar duizenden interacties samenwerken om leven mogelijk te maken.

Op Gist.Science volgen we nauwgezet elke nieuwe preprint op bioRxiv binnen deze discipline. Wij verwerken elk onderzoek direct na publicatie en bieden zowel een toegankelijke samenvatting in gewone taal als een gedetailleerde technische analyse, zodat zowel leken als experts de inzichten kunnen benutten. Hieronder vindt u de meest recente bijdragen aan dit snel evoluerende veld, direct van bioRxiv en nu voor u uitgelicht.

📄 systeembiologie

Unified Network Spectroscopy: Inferring Reduced Biological Dynamics from Fluctuations under Structured Noise and Broken Ergodicity

Dit artikel introduceert Unified Network Spectroscopy (UNS), een inverse operator die gereduceerde biologische dynamiek afleidt uit fluctuatiedata door uitdagingen zoals ruisanisotropie, niet-evenwichtsprobaibiliteitsstromen en niet-ergodiciteit rigoureus aan te pakken om dominante tijdschalen, frequenties en ruisstructuren te herstellen, zelfs wanneer de steekproefomvang kleiner is dan het aantal variabelen.

Milinkovic, A., Stojanovic, L.2026-10-07
📄 systeembiologie

Aged white adipose tissue is rejuvenated in a young host through thermogenic remodeling of mature adipocytes

Deze studie toont aan dat het transplanteren van verouderd wit vetweefsel in een jonge gastheer de biologische leeftijd ervan omkeert door thermogene remodelering te activeren en de ophoping van lipiden in volwassen adipocyten te onderdrukken, waardoor een gedeeltelijk omkeerbaar verjongingsprogramma wordt onthuld dat de levensduur reguleert.

Moldakozhayev, A., Tyshkovskiy, A., Nigro, P., Zhang, Z., Tskhay, A., de Magalhaes, C. G., Yadav, S., Ying, K., Eames, A (…)2026-09-30
📄 systeembiologie

Multi-Omic, Multi-Tissue Responses to Acute Exercise in Sedentary Adults: Findings from the Molecular Transducers of Physical Activity Consortium

Deze studie presenteert de eerste bevindingen van een menselijke cohort uit het Molecular Transducers of Physical Activity Consortium (MoTrPAC), waarbij de globale acute multi-omische reacties in skeletspier, vetweefsel en bloed bij sedentaire volwassenen gerandomiseerd naar uithoudingstraining of weerstandstraining worden gekarakteriseerd om sleutelpaden en nieuwe exerkines te identificeren die de voordelen van lichaamsbeweging mediëren.

MoTrPAC Study Group,, Katz, D. H., Jin, C. A., Many, G. M., Smith, G. R., Keshishian, H., Clark, N. M., Iyer, G., Ahn, C (…)2026-09-30
📄 systeembiologie

Comprehensive in silico analysis reveals candidate regulatory mechanisms underlying selective cerebellar vulnerability in pontocerebellar hypoplasia

Deze studie maakt gebruik van een multi-level *in silico* raamwerk om aan te tonen dat pontocerebellaire hypoplasie voortkomt uit variant-specifieke moleculaire verstoringen en stadium-specifieke, gecoördineerde genexpressie tijdens de cerebellaire ontwikkeling, in plaats van globale verrijking, waardoor de selectieve cerebellaire kwetsbaarheid van de stoornis wordt verklaard.

Branco, L., Mayer, S.2026-09-29
📄 systeembiologie

A Mechanistic Model for the HPA Axis Cortisol Paradox in PTSD

Dit artikel stelt een wiskundig model op systeemniveau voor dat aantoont dat een verhoogde gevoeligheid van de glucocorticoïdreceptor, gecombineerd met dynamische veranderingen in de functionele massa van de klier, de cortisolparadox bij PTSS oplost door uit te leggen hoe individuen een laag basaal cortisol en een afgestompte stressrespons kunnen vertonen terwijl zij tegelijkertijd een verhoogde glucocorticoïdsignalering ervaren.

Danan, D., Grosskopf, Y., Hayut, Y., Toledano, Y., Doenyas-Barak, K., Mayo, A., Alon, U.2026-09-28
📄 systeembiologie

Limit-pushing overexpression reveals constraints on protein abundance

Door een grensverleggende overexpressie-aanpak in *Saccharomyces cerevisiae* te hanteren, kwantificeert deze studie de brede variatie in tolerantie voor eiwitabundantie (IE50) en onthult zij dat overexpressietoxiciteit een kwantitatieve eigenschap is die gekoppeld is aan specifieke eiwitkenmerken, zoals structurele orde en lokalisatie, evenals sequentieafhankelijke capaciteiten voor intracellulaire organisatie.

Namba, S., Nishida, Y., Boone, C., Andrews, B., Moriya, H.2026-09-28
📄 systeembiologie

Accessing Enzyme Kinetic Data and Prediction Methods at Scale

De auteurs presenteren OpenKinetics, een open-source platform en dataportaal dat dertien methoden voor de voorspelling van enzymkinetica integreert met gecureerde datasets en gestandaardiseerde API's om softwarefragmentatie te overwinnen, de betrouwbaarheid van voorspellingen te contextualiseren en grootschalige metabole modellering te faciliteren.

Alwer, S., Escoffier, H., Taha, K., Boorla, V., Yu, H., Santra, S., Wang, Z., Egwu, C., Osinuga, A., Dey, S., Raghunath (…)2026-09-28
📄 systeembiologie

Mouse lymph node colonization models predict human tumor metastasis in melanoma

Door muis-lymfeklierkolonisatiemodellen met humane melanoomdata te integreren via een computationeel framework, identificeert deze studie specifieke transcriptionele programma's en cellulaire ecotypes die metastatische uitkomsten bij patiënten voorspellen en valideren de bruikbaarheid van preklinische modellen voor het begrijpen van tumorprogressie.

Ball, B. K., Al-Humadi, R., Zdravkovic, S., Ilerten, I., Benard, B. A., Howitt, B. E., Gentles, A. J.2026-09-23